يعود اسم البحر الأحمر إلى ثلاث نظريات:
1- وجود مجموعة سكانية كانت تحمل اسم الأحمر قرب شواطئه.
2- في الماضي كان البعض يستخدمون الألوان للإشارة إلى الاتجاه ، والأحمر كان يعني الجنوب تماماً مثل أن سبب تسمية البحر الأسود أنه تعود إلى الشمال.
3- تجمع بعض أنواع الشعب المرجانية بلون أحمر عند شواطئه مما يعطي لوناً أحمر على مدى طويل مع انعكاسات الشمس، هذه النظرية هي الرائجة الآن لدى الأكاديميين ويرونها الأقرب للصحة.